وأخذ علم النسب عن شيخه النسابة السيد حسون البراقي النجفي صاحب كتاب تاريخ الكوفة المطبوع بالنجف، وعن النسابة السيد جعفر الأعرجي الكاظمي صاحب كتاب مناهل الضرب في أنساب العرب وغيره من الكتب والرسائل، وأخذ العلوم الغريبة والشوارد عن والده العلامة سيد الأطباء وعن بعض علماء الهند، ونروي عنه بالإجازة والقراءة والعرض وغيرها من أنحاء تحمل الحديث، وهو يروي عن ثقة الاسلام النوري وعن أساتيذه المذكورين، خلف من الذكور الحقير شهاب الدين الحسيني النجفي جامع هذه الأحرف، وأخي الحجة السيد ضياء الدين مرتضى حرسه الله تعالى وكلاه بلطفه.
وصورة نسبه الشريف المنتهي إلى علي المرعشي هكذا، فخذ ما وعدناك وكن من الشاكرين.
هو العلامة السيد شمس الدين محمود بن العلامة السيد علي شرف الدين بن العلامة الحاج السيد محمد الفلكي بن العلامة الحاج السيد محمد إبراهيم بن العلامة السيد شمس الدين بن العلامة السيد قوام الدين مجد المعالي بن العلامة السيد نصير الدين النسابة بن العلامة النسابة السيد جمال الدين بن العلامة النسابة السيد علاء الدين نقيب الأشراف بن الوزير الأكرم السيد محمد خان بن نقيب الأشراف السيد أبي المجد النقيب الزاهد الشهيد بيد الأكراد الشافية ابن المطاع الأعظم السيد محمد خان الوزير وهو الجامع بين هذه السلسلة الجليلة والسادة الشهرستانية المرعشية بكربلا وسلسلة السيد المحقق الداماد والسيد محمد خان الوزير ابن السلطان الأعظم السيد عبد الكريم خان الثاني بن السلطان الأعظم السيد عبد الله خان بن السلطان الأعظم السيد عبد الكريم خان الأول بن السلطان الأعظم السيد محمد خان بن السلطان الأعظم السيد مرتضى خان بن السلطان الأعظم