60 - غاية الأحكام في تصحيح تلخيص المرام - كتبه على كتابه التلخيص 61 - غاية السؤول في شرح مختصر منتهى المأمول 62 - قواعد الأحكام في معرفة مسائل الحلال والحرام - مجلدان، بلغت مسائله 6600 مسألة شرعية. وهو كثير الشروح والحواشي، منها: شرح السيد عميد الدين - ابن أخت العلامة - ولولد العلامة: فخر المحققين: إيضاح على كتاب الفوائد في شرح القواعد.
63 - القواعد الجلية في شرح الرسالة الشمسية، لأستاذه الكاتبي المعروف بدبيران. توجد نسخته بخطه الشريف في الخزانة الرضوية المقدسة.
64 - القواعد والمقاصد - في المنطق والطبيعي والإلهي.
65 - القول (السر) الوجيز في تفسير الكتاب العزيز 66 - كاشف الأستار في شرح كشف الأسرار - مجلد.
67 - كتاب السلطان.
68 - كشف الحق ونهج الصدق - مطبوع في بغداد - صنفه باسم السلطان خدابنده، كما صرح العلامة في خطبته، وهو الذي رده الفضل بن روزبهان، ورد على رد الفضل: القاضي الشهيد نور الله التستري بكتاب أسماه (إحقاق الحق وإزهاق الباطل) كما رد عليه أيضا: الحجة الحسن المظفر بكتاب أسماه (دلائل الصدق) وهما مطبوعان.
69 - كشف الخفاء من كتاب الشفاء - في الحكمة - لابن سينا. خرج منه مجلدات.
70 - كشف الفوائد في شرح قواعد العقائد.
71 - كشف المراد في شرح تجريد الاعتقاد - لأستاذه الخواجة نصير الدين الطوسي - في علم الكلام. مطبوع، وله شرح منطقه خاصة أسماه (الجوهر النضيد في شرح منطق التجريد).