معجم المفردات اشتمل هذا المعجم على توضيح لمعاني بعض الكلمات التي تحتمل غرابتها على غير الناطقين بالعربية تيسيرا لفهمها والاستفادة منها. وقد اعتمدت في إعداده مجموعة من الأسس:
1 - شرح المفردات وفقا للمعنى الذي استخدمه المؤلف (قدس سره) في الجزء الثالث والرابع من المكاسب.
2 - ترتيب المحتوى ألفبائيا استنادا إلى هيئة الكلمة.
3 - التقيد بألفاظ معاجم اللغة المعتبرة والتلفيق بينها بنحو مختصر.
4 - عدم تكرار معنى بذاته وإن اختلفت هيئة الكلمات، والإحالة على المفردات المشروحة من قبل، سواء أكان في هذا المعجم، أم في " معجم المفردات الغريبة " للجزء الثاني من كتاب المكاسب، طبعة مجمع الفكر الإسلامي.
5 - الإشارة إلى الأصل الفارسي الذي عربت عنه بعض الكلمات، والاستعانة بمعاجم اللغة الفارسية لتوثيق ذلك.
6 - في المصطلحات الفقهية والأصولية، إما أن يذكر المعنى اللغوي أولا ثم المعنى الاصطلاحي، أو يذكر الثاني مباشرة.
7 - ختمت كل فقرة بالمصادر المعتمدة. وقد رمز إلى معاجم اللغة بحروف