أسرار هجرة النبي (صلى الله عليه وآله) إلى المدينة كثيرة منها: تسليمه ورضاؤه بقضاء الله وقدره، وبيان فضل أمير المؤمنين في ليلة المبيت وغيرها، وبيان أحوال صاحبه في الغار إلى غير ذلك مما ذكره في البحار (1).
أسرار بعض العبادات تذكر في باب علل الشرايع والأحكام (2).
سر سؤال موسى عن حل عقدة لسانه في قوله: * (واحلل عقدة من لساني) * (3).
سر أخذ موسى برأس أخيه وبلحيته. وسر أخذ الحسين (عليه السلام) لحيته يوم عاشوراء. وسر تعبير هارون عن موسى: يا بن أم (4).
سر ما صدر من الخضر من خرق السفينة وقتل الغلام وإقامة الجدار، وسر التعبير عن الأول ب‍ * (أردت) * وعن الثاني ب‍ * (أردنا) * وعن الثالث ب‍ * (أراد ربك) * (5).
سر ترك الحسين (عليه السلام) البيعة لمعاوية (6).
سر رفع رسول الله (صلى الله عليه وآله) عليا صلوات الله عليه على كتفه لحط الأصنام دون العكس (7).
إيداع أمير المؤمنين (عليه السلام) أسراره في البئر (8).
قول أبي خديجة لأمير المؤمنين (عليه السلام): أعندك سر من سر رسول الله (صلى الله عليه وآله) تحدثنا به؟ قال: نعم، يا قنبر إئتني بالكتابة. ففضها، فإذا هي أسفلها سليفة مثل ذنب