46 - مسألة في كونه تعالى عالما.
47 - مسألة في الإرادة.
48 - مسألة أخرى في الإرادة.
49 - مسألة في التوبة.
50 - مسألة في الولاية من قبل السلطان، وفي بعض الفهارس (مسألة في قتل السلطان).
51 - مسألة في التأكيد.
52 مسألة في دليل الخطاب.
53 - المصباح في الفقه.
54 - شرح مسائل الخلاف.
55 - مسألة في المتعة.
56 - المسائل المحمديات، خمس مسائل.
57 - المسائل البادرائيات أربع وعشرون مسألة.
58 - المسائل الرمليات سبع مسائل.
59 - المسائل التبانية عشرة مسائل طبعت، ثلاث مسائل سأل عنها السلطان.
69 - كتاب الوعيد، لعله المتقدم في رقم 7.
61 - تفسير قصيدته.
كما أن تلميذه الشيخ محمد بن محمد البصروي كتب أول فهرس لمؤلفات أستاذه الشريف المرتضى قدس سرهما إلى سنة 417 هجرية وفيه صورة إجازة المرتضى برواية هذا الفهرست، ننقله نصا كما ورد مقدمة ديوان المرتضى لرشيد