النسخة المرقمة 12900، لمكتبة الإمام الرضا عليه السلام، كتبت سنة 1238 ه.
43 - النسخة المرقمة 13218، لمكتبة الإمام الرضا عليه السلام، كتبت سنة 1057 ه.
44 - النسخة الأولى من المجموعة المرقمة 841 لمكتبة المدرسة الفيضية بمدينة قم المقدسة، كتبت سنة 1293 ه.
45 - النسخة الأولى من المجموعة المرقمة 1661 لمكتبة المدرسة الفيضية بمدينة قم المقدسة، كتبت سنة 1255 ه.
46 - النسخة المرقمة 481 لمكتبة المدرسة الحجتية بقم، كتبت في القرن 11، 12 ه.
وقد كانت بأيدينا عشر من هذه النسخ نفيد منها في التحقيق سنقوم بتعريفها فيما يلي.
النسخة الأولى والثانية من هذه النسخ أحسن النسخ وأكثرها اعتبارا، فقد كتبهما تلميذ الشهيد قليلا بعد تأليفه الكتاب، وقد سمعاه عن الشهيد وعليهما خطه وإنهاؤه.
وقد كتب المرحوم الشيخ آقا بزرگ الطهراني بشأن النسخة الثانية، أي نسخة مكتبة المرحوم القمشهي (قده) ذيل ترجمة بن محمد الجبعي، العاملي من تلامذة الشهيد، كتب يقول:
" سلمان بن محمد العاملي من تلامذة الشهيد الثاني، رأيت بخط الشهيد إجازته لصاحب الترجمة (راجع " الذريعة " ج 1 / 194، الرقم 1003) على ظهر " منية المريد " تاريخها يوم الخميس 2 ذي القعدة، 954 ه ق، رأيته في كتب مولانا الآخوند محمد حسين بن محمد قاسم القمشهي المتوفى في النجف 1336، ضمن مجموعة خمس رسائل كلها الشهيد: أولها " نتائج الأفكار " ثم " المنية " ثم " كشف الريبة " ثم " مسكن الفؤاد " ثم " مسألة في الطلاق " كلها بخط صاحب الترجمة، وصورة خط الشهيد هذه: الحمد لله حق حمده، سمع علي هذا الكتاب كاتبه المولى الاجل الفاضل خلاصة الأخيار الشيخ سلمان - أحسن الله تعالى توفيقه وسهل إلى كل خير طريقه - في مجالس آخرها: يوم الخميس ثاني شهر ذي القعدة الحرام عام أربع وخمسين وتسعمائة من الهجرة النبوية. وكتب مؤلفه العبد الفقير إلى الله تعالى زين الدين بن علي بن أحمد حامدا لله تعالى مصليا مسلما ".
.