مصورة في جامعة طهران رقم 1715 ذكرت في فهرسها 1 / 288 (1).
(17) إيضاح المعضلات من شرح الإشارات.
ذكره في الخلاصة كما في النسخة التي اعتمد عليها في البحار، وكذا ذكره في الإجازة كما في النسخة التي اعتمد عليها في البحار والرياض، وفي الإجازة المطبوعة: إيضاح المعضلات في شرح الإشارات مجلد.
والإشارات لأبي علي ابن سينا، وشرحه للمحقق الطوسي والموسوم بحل مشكلات الإشارات، فالعلامة أوضح معضلات شرح النصير الطوسي على الإشارات (2).
(18) إيضاح المقاصد من حكمة عين القواعد.
ذكره في الخلاصة، وعين القواعد - الذي هو في المنطق - لعلي الكاتبي القزويني المتوفى سنة 675، ولما التمس منه بعض طلبته بعد ما فرغوا من بحث رسالة عين القواعد أن يضيف إليها رسالة في الإلهي والطبيعي فأجاب وسماها حكمة العين، فالعلامة شرح حكمة العين.
من أهم نسخه:
نسخة في مكتبة الشعب في مدينة أدانا في تركيا، ضمن المجموعة رقم 3 / 177، كتبها جعفر الاسترآبادي في شهر رمضان سنة 707، ذكرت في الفهرس الموحد لمخطوطات تركيا 1 / 860.
نسخة في مكتبة جامعة طهران، رقم 423، كتبها حسين بن محمد بن حسن ابن سليمان في أول شهر رمضان سنة 731، نسخة في مكتبة ديار بكر في تركيا، رقم 1893، كتبت في سنة 778،