مدفون در قبرستان بقيع است و آن صندوق مطهر كه رشك صندوق آسمان و مخزن جواهر حكمت و ايمان است، بر بالاى قبور ايشان نهاده اند و ابواب رحمت از آن قبهء مقدسه بر عالم گشاده اند. (1) " اللهم صل على سيدنا محمد وآل سيدنا محمد سيما الأمام الطهر الطاهر محمد الباقر و سلم تسليما ". (2) 15. گفتار حافظ حسين:
حافظ حسين كربلائى تبريزى (م 994): در مورد اين امام همام مى نويسد:
" فى ذكر الإمام الهمام، قمر الأقمار، ونور الأنوار، و سيد الأبرار، وقائد الأخيار، الإمام الباقر، والطهر الطاهر، والنجم الظاهر، والبحر الزاخر، السيد الوجيه، والإمام النبيه، المدفون عند أبيه، الحبر الملي عند العدو والولى، ابى جعفر محمد بن على ".
وى امام پنجم است از ائمهء اثنى عشر " المعروف بالباقر، سمى بذلك لأنه بقر العلم أي شقه فعرف اصله وعلم خفيه. وتبقر في العلم اى توسع وبقر عن العلوم: فتش عنها " ومادر وى ام عبد الله بنت الحسن بن على بن ابيطالب است. " و هو أول علوى ولد بين علويين، تابعى جليل، امام بارع، مجمع على جلالته، معدود في فقهاء المدينة وائمتهم ... ".
ترجمه عبارت آنست:
" امام همام، ماه ماهان، نور الأنوار، سيد و سرور ابرار و نيكوكاران، پيشواى اخيار امام باقر، پاك و پاكيزه، ستارهء درخشان، درياى جوشان، سرور آبرومند، امام آگاه، فردى كه در كنار پدرش مدفون مى باشد دانشمند پر از علم پيش دوست و دشمن ".
و در كتاب " كشف المحجوب " آمده است: