المعظم سنة 1263 ".
ورمزنا لها ب‍ " م ".
2 - صورة فوتوغرافية عن مخطوطة مكتبة المسجد الأعظم في قم برقم 3230:
ضمت الكتاب كله من أول القطع إلى آخر التراجيح في 526 صفحة، وهي ناقصة الأول بمقدار نصف صفحة، جيدة الخط، قد تفردت بقسم من العبارات، واحتوت على بعض الأخطاء الواضحة، تأريخ تدوين موضوع الظن فيها سنة 1266 ه‍ ق، ابتدأت بقوله: "... كان كذلك فهو حرام، هذا بخلاف القطع... ".
ورمزنا لها ب‍ " ظ ".
3 - صورة فوتوغرافية عن نسخة مطبوعة في حياة المؤلف قدس سره عثرنا عليها في بعض مكتبات دزفول الخاصة:
وهي أول نسخة مطبوعة، اشتملت على 320 صفحة بالقطع الوزيري، احتوت على القطع والظن فقط، مع مقدمة للتعريف بالكتاب والمؤلف بقلم عبد الحسين التستري، ورد في آخرها: " قد اتفق الفراغ من تسويد هذه النسخة الموسومة بحجية المظنة من تصنيفات العالم الفاضل العارف الكامل الشيخ مرتضى من الله على المسلمين بطول بقائه، ونور ساحة الإسلام بشعشعة شمس جماله في ثالث عشر شهر ربيع الثاني من شهور سنة ثمان وستين ومائتين من بعد ألف من الهجرة... قوبلت النسخة مع ما صححه المصنف بنظره الشريف من أولها إلى آخرها، ولا نسخة أصح منها بظاهرها، ولله الحمد على كل حال، فإنه العلي المتعال ".
ورمزنا لها ب‍ " ل ".