كتاب النهروان، كتاب مقتل علي، كتاب مقتل الحسين، كتاب التوابين، كتاب أخبار المختار، كتاب السرائر، كتاب المعرفة، كتاب الجامع الكبير في الفقه، كتاب فضل الكوفة ومن نزلها من الصحابة، كتاب الدلائل، كتاب من قتل من آل محمد، كتاب التفسير، وغير ذلك.
روى عنه أحمد بن علي الإصبهاني، والحسن بن علي بن محمد الزعفراني، ومحمد بن زيد الرطال، آخرون.
وكان أخوه علي قد هجره وباينه بسبب الرفض.
قلت: أرخ الطوسي وفاته سنة ثلاث وثمانين ومائتين ".
وقال الناقد الجليل الشيخ محمود حسن التونكي في معجم المصنفين تحت عنوان " إبراهيم الثقفي الإصفهاني " (ج 4، ص 401 - 404):
" الشيخ كبير الشيعة أبو إسحاق إبراهيم بن محمد بن سعيد بن هلال بن عاصم بن سعد بن مسعود الثقفي الكوفي الإصفهاني الشيعي كان من كبراء الشيعة وفضلائهم، ولد بالكوفة وتشيع وغلا فيه وصار أحد المشاركين في علومهم ثم ارتحل من بلدة الكوفة وقدم إصبهان وتدير بها، أخرجه ابن النديم البغدادي في فهرست العلماء في أخبار الشيعة منه وقال:
الثقفي أبو إسحاق إبراهيم بن محمد الإصبهاني من الثقات العلماء المصنفين، وله من الكتب كتاب أخبار الحسن بن علي عليهما السلام، وكتاب أخبار الحسين بن علي عليهما السلام (انتهى).
وذكره السمعاني في الأنساب وقال:
إبراهيم بن سعد بن هلال الثقفي وكان علي قد هجره وباينه، وله مصنفات في التشيع، يروي عن أبي نعيم الفضل بن دكين وإسماعيل بن أبان (انتهى).
قال الحافظ الذهبي في الميزان:
إبراهيم بن محمد الثقفي عن يونس بن عبيد قال ابن أبي حاتم: هو مجهول وقال البخاري: لم يصح حديثه.