الأول، فتقاطر الطلاب إليه، وتحلقوا حوله يستزيدون من علومه، ثم بعد ذلك حينما هاجر إلى النجف الأشرف عام 448 ه استمر فيها بالتدريس إلى حين وفاته، فخلال هذه الفترة التي استمرت مدة ربع قرن تتملذ على الشيخ مئات الطلاب، لكننا لم نعثر على أسمائهم في كتب التراجم والرجال إلا قلة قليلة لا تتعدى أسماء ثلاثين أو أربعين من مشاهيرهم، وهؤلاء ينقسمون، إلى ثلاثة أقسام: قسم يعدون من طلابه ببغداد، وآخرون في النجف الأشرف، وقسم ثالث يشك في تلمذتهم على الشيخ نفسه ولعل بعضم تتملذ على ولده الشيخ أبو علي الحسن بن محمد بن الحسن الطوسي. وإليك أسمائهم:
القسم الأول:
1 - آدم بن يونس بن أبي المهاجر النسفي 2 - أحمد بن الحسين بن أحمد النيسابوري (ت 480 ه) 3 - إسحاق بن محمد بن بابويه القمي 4 - إسماعيل بن محمد بن الحسن بن بابويه القمي (ت 500 ه) 5 - بركة بن محمد بن بركة الأسدي 6 تقي بن نجم الحلبي المكنى بأبي الصلاح الحلبي (ت 447 ه) 7 - جعفر بن علي بن جعفر الحسيني 8 - الحسن بن عبد العزيز بن الجبهاني 9 - الحسن بن محمد بن الحسن الطوسي (توفى حدود سنة 515 - 511 ه) 10 - السيد ذو الفقار بن محمد بن معبد الحسيني المروزي