نفائسه المفقودة وله غير هذه الروائع الخالدة نفائس، لولا عدوان سنة العشرين عليها بالحرق والتمزيق، لكانت من الذخائر المعدودة في كنوز العقل والفكر، ولكنها فقدت في تلك الأحداث المؤلمة، فمني بفقدانها العلم بخسارة عسى أن يتسع وقت سيدنا للتعويض عنها بإحيائها من جديد، ونسردها فيما يلي كما يذكرها المؤلف في آخر تعليقته على - الكلمة الغراء -.
1 - شرح التبصرة في الفقه على سبيل الاستدلال خرج منه ثلاثة مجلدات تتضمن كتب الطهارة والقضاء والشهادات والمواريث.
2 - تعليقة على الاستصحاب من رسائل الشيخ - في الأصول - في مجلد واحد.
3 - رسالة في منجزات المريض استلالية.
4 - سبيل المؤمنين - في الإمامة - يقع في ثلاثة مجلدات.
5 - النصوص الجلية في الإمامة أيضا فيه أربعون نصا أجمع على صحتها المسلمون كافة، وأربعون من طرق الشيعة مجلوة بالتحليل والفلسفة.
6 - تنزيل الآيات الباهرة في الإمامة أيضا وهو مجلد واحد يبتني على مائة آية من الكتاب نزلت في الأئمة بحكم الصحاح.
7 - تحفة المحدثين فيما أخرج عنه الستة من المضعفين. وهو كتاب بكر في الحديث لم يكتب مثله من قبل.
8 - تحفة الأصحاب في حكم أهل الكتاب.