ومن دعاء له (عليه السلام) عند النوم:
" بسم الله، اللهم إني أسلمت نفسي إليك، ووجهت وجهي إليك، وفوضت أمري إليك، والجأت ظهري إليك، وتوكلت عليك رهبة منك ورغبة إليك، لا منجى ولا ملجأ منك إلا إليك، آمنت بكتابك الذي أنزلت، وبرسولك الذي أرسلت ". ثم يسبح تسبيح الزهراء (عليها السلام).
من دعاء له (عليه السلام) كان يدعو به بعد صلاة الليل:
" لا إله إلا الله وحده لا شريك له له الملك وله الحمد يحيي ويميت ويميت ويحيي وهو حي لا يموت بيده الخير وهو على كل شئ قدير، اللهم لك الحمد يا رب، أنت نور السماوات والأرض فلك الحمد، وأنت قوام السماوات والأرض فلك الحمد، وأنت جمال السماوات والأرض فلك الحمد، وأنت صريخ المستصرخين فلك الحمد، وأنت غياث المستغيثين فلك الحمد، وأنت تجيب دعوة المضطرين فلك الحمد، وأنت أرحم الراحمين فلك الحمد، اللهم بك تنزل كل حاجة فلك الحمد، وبك يا إلهي أنزلت حوائجي الليلة فاقضها لي يا قاضي الحوائج، اللهم أنت الحق، وقولك الحق، ووعدك الحق، وأنت ملك الحق، اشهد أن لقائك الحق، وأن الساعة آتية لا ريب فيها، وأنك تبعث من في القبور، اللهم لك أسلمت، وبك آمنت، وعليك توكلت، وبك خاصمت، وإليك حاكمت، فاغفر لي ما قدمت وأخرت وأسررت وأعلنت، إنك الحي الذي لا إله إلا أنت ".
روى أبو نعيم في الحلية بسنده عن جعفر بن محمد عن أبيه (عليهما السلام): انه كان في جوف الليل يقول:
" أمرتني فلم أئتمر وزجرتني فلم ازدجر، ها أنا ذا عبدك بين يديك ولا اعتذر ".
وقال الآبي في نثر الدرر كان يقول: