صفاته عليه السلام الخلقية رواه جماعة من أعلام العامة في كتبهم:
فمنهم الفاضل المذكور في الكتاب الماضي ذكره (ص 713 ط دار الفكر العربي) قال:
لم يكن الجود في أبناء علي غريبا، فإنه يروي قوله تعالى: (ويطعمون الطعام على حبه مسكينا ويتيما وأسيرا) نزلت في علي كرم الله وجهه، كما يروى مثل ذلك في قوله تعالى آية البر (وآتى المال على حبه). وقد كان جعفر يعطي من غير سفه، فكان يعطي من يستحق العطاء، وكان يأمر بعض المتصلين بأن يمنع الخصومات بين الناس إذا كانت على مال، بإعطاء طالب المال من ماله، وكان يقول رضي الله عنه:
لا يتم المعروف إلا بثلاثة: بتعجيله، وتصغيره، وستره.
وكان يسر العطاء في كثير من الأحيان ولا يعلنه، وكان يفعل ما فعله من قبل جده علي زين العابدين، فكان إذا جاء الغلس يحمل جرابا فيه خبز ولحم ودراهم على عاتقه، ثم يذهب إلى ذوي الحاجة من أهل المدينة ويعطيهم، وهم لا يعلمون من المعطي حتى مات، وتكشف ما كان مستورا، وظهرت الحاجة فيمن كان يعطيهم.
وجاء في الحلية: كان جعفر بن محمد يعطي حتى لا يبقى لعياله شيئا.
وقال أيضا في صبره عليه السلام: