فهرس موضوعي للمجلد الأول والثاني توجد ثلاث طرق للباحث أو القاري لكي يجد الموضوع الذي يريده عن الإمام المهدي عليه السلام في هذا المعجم:
الطريقة الأولى: مراجعة فهرس الموضوعات العام، حيث جمعنا الأحاديث المتشابهة في كل موضوع، ورتبنا الموضوعات في تسلسل منطقي.
الثانية: مراجعة الفهارس المتنوعة التي تتعلق بغرضه، مثل فهرس الاعلام والأقوام والأماكن وغيرها.
الثالثة: مراجعة الفهرس الموضوعي التالي الذي بذلنا فيه جهدا إضافيا لجمع ما يتعلق بالموضوعات المهمة من مقدمات ظهور المهدي عليه السلام وجوانب شخصيته وحركته وعصره. وقد اقتصرنا فيه على الأحاديث الواردة عن النبي صلى الله عليه وآله لأنها بشكل عام موضع اتفاق بين الجميع، وان كانت الأحاديث الواردة عن الأئمة من أهل البيت عليهم السلام تضيف أضواء أخرى أساسية وهامة أيضا، كما سترى إن شاء الله تعالى.
ملاحظة: وجود النجمة بعد الرقم يدل على أن الموضوع مذكور في مصادر الحديث وليس في متنه الأول.