تأسيس علم الجبر والمقابلة وحل المعادلات الجبرية كان من علماء الإسلام، ولم يكن اسم منه عند الرياضيين قبل الإسلام).
وقال عبد الحليم الجندي في كتابه الإمام جعفر الصادق ص 295:
وربما كان الكلام المنقول عن جابر بن حيان أوضح كلام في الدلالة على المنهج التجريبي الذي تعلمه في مجلس الإمام أو من كتب الإمام. يخاطب جابر الإمام في مقدمة كتابه الأحجار بقوله: وحق سيدي لولا أن هذه الكتب باسم سيدي صلوات الله عليه، لما وصلت إلى حرف من ذلك إلى الأبد...
ويقول جابر في كتابه الخواص عن طريقته: (إتعب أولا تعبا واحدا واعلم ثم اعمل. فإنك لا تصل أولا، ثم تصل إلى ما تريد). وفي كتابة السبعين يقول: (من كان دربا (مجربا) كان عالما حقا. ومن لم يكن دربا لم يكن عالما. وحسبك بالدربة في جميع الصنائع أن الصانع الدرب يحذق وغير الدرب يعطل). ويحصل جابر طريقته في عبارته المأثورة:
(علمته بيدي. وبعقلي. وبحثته حتى صح، وامتحنته فما كذب) وفي هذا المقام يقول أستاذ الفلسفة الإسلامية المعاصر في جامعة القاهرة د. زكي نجيب محمود: (.. فلو شئت تلخيصا للمنهج الديكارتي كله لم تجد خيرا من هذا النص الذي أسلفناه عن جابر). (ديكارت 1596 - 1650 - Rene Descartes أصلا).
ويرى الصيدلي المعاصر د. محمد يحيى الهاشمي: أن الواقعية هي التي سوغت لجابر أن يقسم القياس أو الإستدلال والاستنباط إلى ثلاثة أقسام: المجانسة ومجرى العادة وبالآثار، ومن دلالة المجانسة دلالة الأنموذج كمن يريك بعض الشئ دلالة على كله. وهو استدلال غير قاطع، إذ الأنموذج لا يوجب وجود شئ من جنسه يساويه تماما في الطبيعة والجوهر. وكذلك دلالة مجرى العادة فإنه كما يقول جابر (ليس فيه علم يقين واجب اضطراري برهاني، بل علم إقناعي يبلغ أن يكون: أحرى وأولى وأجدر لا غير، لكن استعمال الناس له وتقبلهم فيه واستدلالهم به والعمل في أمورهم عليه أكثر كثيرا جدا.. وليس في هذا الباب علم يقين واجب، وإنما وقع منه تعلق واستشهاد الشاهد على الغائب، لما في النفس من الظن والحسبان، فإن الأمور ينبغي أن تجري على نظام ومشابهة