وردت في المصادر نصوص عديدة، إضافة إلى إشارة رسول الله (صلى الله عليه وآله وسلم)، والأئمة (عليهم السلام) من بعده على إمامة أبي جعفر الثاني محمد بن علي الجواد (عليه السلام)، عن عدة من الثقات الأمناء من أصحابه وأهل بيته، مثل عم أبيه علي بن جعفر الصادق، وصفوان بن يحيى، ومعمر بن خلاد، وابن أبي نصر البزنطي وغيرهم.
نص الرسول (صلى الله عليه وآله وسلم):
وأول النصوص الدالة على إمامته هو أن رسول الله (صلى الله عليه وآله وسلم) قد أشار إليه في الحديث الذي سبق في موضوع نسبه الشريف من قوله (صلى الله عليه وآله وسلم): " بأبي ابن خيرة الإماء ابن النوبية الطيبة ". ويورده الشيخ المفيد - عليه الرحمة - في إرشاده بسنده عن علي بن جعفر الصادق (عليه السلام)، أن الإمام الرضا (عليه السلام) يرويه عن أبيه، عن رسول الله (صلى الله عليه وآله وسلم):
قال الشيخ المفيد: أخبرني أبو القاسم جعفر بن محمد، عن محمد بن يعقوب، عن علي بن إبراهيم بن هاشم، عن أبيه وعلي بن محمد القاساني جميعا عن زكريا بن يحيى بن النعمان قال: سمعت علي بن جعفر بن محمد يحدث الحسن بن الحسين بن علي بن الحسين فقال في حديثه: لقد نصر الله أبا الحسن الرضا (عليه السلام) لما بغى عليه إخوته وعمومته.. وذكر حديثا طويلا حتى انتهى إلى قوله: فقمت وقبضت على يد أبي جعفر محمد بن علي الرضا (عليه السلام) وقلت له: أشهد