9 - النسخة المحفوظة في مكتبة جامع گوهرشاد بمدينة مشهد المقدسة تحت رقم 56، تبدأ بكتاب الفراق إلى آخر وصية العلامة الحلي لولده فخر المحققين رضوان الله عليهما الواردة في آخر كتاب قواعد الأحكام. مجهولة الناسخ والتاريخ.
رمزنا لها بالحرف (ق).
10 - النسخة المحفوظة في خزانة المكتبة الوطنية (ملي) بطهران تحت رقم 6850، كتبها فتح علي في سنة 1203، ضمت بين دفتيها كتاب الفراق إلى آخر كتاب الكفارات.
رمزنا لها بالحرف (ي).
11 - النسخة المحفوظة في خزانة الحاج محمد حسين ملك في طهران تحت رقم 2204، كتبها محمد هادي بن السيد صادق وفرغ من نسخها في مدرسة المرحوم الحاج إسماعيل خان بمدينة رشت سنة 1244 هجرية، تبدأ بكتاب الصيد والذباحة إلى آخر وصية السيد المتقدم ذكرها.
رمزنا لها بالحرف (ل).
12 - النسخة المحفوظة في خزانة مكتبة مدرسة الآخوند الهمداني في همدان تحت رقم 487. كتبها الحاج محمد جعفر قراگزلو وتم الفراغ من نسخها سنة 1238 هجرية، تبدأ بكتاب الحدود إلى آخر وصية العلامة.
جاء في هامش الصفحة الأخيرة منها صورة مقابلة نصها: قد قوبلت بنسخة معتمدة قوبلت بنسخة من خط المصنف،.
رمزنا لها بالحرف (ه‍).
13 - كما اعتمدنا النسخة المطبوعة على الحجر، والمتداولة في الأسواق، والذي كتبها علي نقي بن محمد في شهر شوال سنة 1271 هجرية، وقام بتصحيحها ومقابلتها الحاج ميرزا باب في شهر محرم الحرام سنة أربع وسبعين ومائتين بعد الألف من الهجرة.
ورمزنا لها بالحرف (ط).