(5) دعاى آن حضرت براى فرزندش حضرت مهدى (عليه السلام) يونس بن عبد الرحمان از امام رضا (عليه السلام) روايت كرده كه آن حضرت به دعا براى صاحب الزمان (عليه السلام) امر مىفرمود، و يكى از دعاهاى ايشان براى آن حضرت چنين بود:
پروردگارا! بر محمد و خاندانش درود فرست، و از دوستت و جانشينت و حجتت بر خلقت، و زبانت كه از جانب تو معرف توست، گوياى به حكمتت و چشمان بيناى تو در مخلوقاتت، و گواه بر بندگانت، بزرگمرد مجاهد كوشا، بنده پناهنده به تو دفاع كن.
خداوندا! او را از شر آنچه آفريده و پديد آورده و ايجاد نموده و پرورانده و تصوير نمودى، در امان دار، و او را از پيش رو و از پشت سر و از طرف راست و چپ، و از بالا و پائينش محافظت بفرما، آنگونه كه هر كه در حفاظت تو باشد ضايع نگردد.