المجلسي رحمه الله في كتابه المذكور، فقد كان من الطبيعي ان تنيط إدارة المؤسسة - بعد أن وقع اختيارها المبتني على دراسة دقيقة وشاملة لمصادر هذه الموسوعة - مسؤولية تحقيق هذا السفر الجليل بلجنة مصادر البحار في المؤسسة، والتي بادرت - ووفقا لمنهجية عمل المؤسسة الجماعي - إلى تشكيل جملة من اللجان المتخصصة التي أناطت بكل واحدة منها جانبا من هذا العمل التحقيقي.
وقد كانت الخطوة الأولى هي الحصول على نسخ مخطوطة نفيسة لهذا الكتاب، وحيث وقع اختيارها - بعد الفحص والتقصي الدقيقين - على النسختين المخطوطتين التاليتين:
1 - نسخة ثمينة مصورة محفوظة في مكتبة العلامة المحقق السيد عبد العزيز الطباطبائي رحمه الله يعود تأريخ نسخها إلى القرن السابع الهجري، وكان سماحته قد زودنا بها أيام حياته مع توجيهات كريمة منه لعموم ما يتصل بهذا العمل وتحقيقه، كعادته رحمه الله في عموم أعمال المؤسسة التحقيقية المتواصلة - وقد رمزنا لها بالحرف (ط) - جزاه الله تعالى عنا وعن أهل بيت العصمة عليهم السلام أفضل وأحسن الجزاء.
2 - النسخة المحفوظة في مكتبة ملك / طهران، برقم 1902 ويعود تأريخها إلى عام 967 ه‍، والموسومة بربيع الشيعة، ورمزها (ق).
3 - ولما كان الكتاب مصدرا لبحار الأنوار فقد اعتمدناه نسخة ثالثة، أضف ان نسخة العلامة المجلسي رحمه الله هي بخط المصنف رحمه الله.
4 - النسخة المطبوعة في بيروت عام 1985 م حيث كانت مصب العمل ورمزها (م).
هذا، وقسمت الأعمال على اللجان التالية.
1 - المقابلة، وعملها مقابلة النسخ، وثبت الاختلافات، وتولى مسؤولية