ومن رواة النص عليه من أبيه: إسماعيل بن محمد بن عبد الله بن علي بن الحسين وزيد بن علي، وعيسى عن جده، والحسين بن أبي العلاء.
ولما حضرت زين العابدين الوفاة قال: يا محمد احمل هذا الصندوق. فلما توفي جاء اخوته يدعون فيه، فقال الباقر: والله ما لكم فيه شئ ولو كان لكم شئ لما دفعه إلي وكان في الصندوق سلاح رسول الله صلى الله عليه وآله.
والذي يدل على إمامته ما ثبت من وجوب الإمامة وكون الامام معصوما ومنصوصا عليه وان الحق لا يخرج من بين الأمة. وفي النكت: ان الأصول خمسة والأشباح خمسة، والصلوات خمس، والعبادات خمس، والحمد خمس، والأصابع خمس، والأسابيع (خمسة)، والحواس خمسة، وعلم التصريف مبني على خمس زيادة وحذف وتغيير بحركة وسكون وابدال وادغام، والباقر خامس الأئمة، وميزان محمد الباقر الحساب هو: جواد زاهد معصوم لاستوائهما في أربعمائة وست وعشرين قال أبو نواس:
فهو الذي قدم الله العلي له * ان لا يكون له في فضله اثان فهو الذي امتحن الله القلوب به * عما تجمجمن من كفر وايمان وان قوما رجوا ابطال حقكم * أمسوا من الله في سخط وعصيان لن يدفعوا حقكم إلا بدفعهم * ما انزل الله من آي وقرآن فقلدوها لأهل البيت انهم * صنو النبي وأنتم غير صنوان وقال منصور:
وما أخل وصي الأوصياء به * محمد بن علي نوره الصدع ذرية بعضها من بعض اصطنعت * فالحق ما صنعوا والحق ما شرعوا يا ابن الأئمة من بعد النبي ويا * ابن الأوصياء أقر الناس أم دفعوا ان الخلافة كانت إرث والدكم * من دون تيم وعفو الله متسع وقال أبو هريرة:
أبا جعفر أنت الامام أحبه * وارضى الذي ترضى وأتابع اتانا رجال يحملون عليكم * أحاديث قد ضافت بهن الأضالع وقال الحميري:
وإذا وصلت بحبل آل محمد * حبل المودة منك فابلغ وازدد بمطهر لمطهرين أبوة * نالوا العلى ومكارم لم تنفد