لوقتنا الحاضر سوى صحائف من كتابه معجم البلدان و " ثلاثة مجالس " من أماليه الثلاثمئة تحتفظ بها بعض مكتبات العالم.
وبعد استقصائنا للمصادر أمكننا تدوين ثبت بمؤلفاته وهي:
1. تفسير القرآن (التفسير المسند للقرآن)، في سبعة مجلدات.
ذكره الذهبي في سير أعلام النبلاء (ج 17، ص 308)، والداوودي في طبقات المفسرين (ج 1، ص 94)، وابن الغزي في ديوان الإسلام (ج 4، ص 271)، ونقل عنه ابن حجر في الإصابة كثيرا، وفي تهذيب التهذيب (ج 8، ص 192) قال: "... وجدت الحديث في تفسير ابن مردويه ".
2. الأمالي (الثلاثمئة مجلس).
ذكره السمعاني في الأنساب (ج 5، ص 600). وقال في ترجمة الوزير أبي الفتح أحمد بن علي نظام الملك: " سمعت منه مجلسا من أمالي أبي بكر بن مردويه ".
وذكره سزكين في تاريخ التراث العربي (ج 1، ص 462). (1) 3. المستخرج على صحيح البخاري.
أورد ذكره الذهبي في سير أعلام النبلاء (ج 7، ص 308). والداوودي في طبقات المفسرين (ج 1، ص 94).
4. كتاب الصحيح.
ورد ذكره في هامش الإكمال: (ج 6، ص 33) نقلا عن كتاب الاستدراك لابن نقطة، قال: "... حدث عنه الدارقطني...، وأحمد بن موسى بن مردويه في صحيحه ".
قال العلامة الطباطبائي في كتابه أهل البيت في المكتبة العربية (ص 577): " لعله هو المستخرج على صحيح البخاري ".