ساعت تن و سر سيدى بقم به مشهد مطهر بنت الامام الكاظم موسى بن جعفر مدفون است وشيعت عراق بسيارى مرثيه سيدى گفتند، امام افضل الدين علامه ماهبادى گفته شعر:
سلام الله ما طلع الثريا على المظلوم عز الدين يحيى شهيد كالحسين به غير جرم قتيل مثل هابيل ويحيى سيد ناصر الدين ممطير، و مكين الدين قمى، كه اين ساعت وزير امير المؤمنين ناصر الدين الله است بر دراز گوش نشانده ايشان را به نهاوند بردند، و از آنجا به بغداد افتادند، و بعد مؤيد الدين وزارت بغداد امير المؤمنين به امير سيد الامام ناصر الدين داد، و لقب نصير الدين فرمود كرد، و حكم و تمكين و مرتبه او بدانجا رسيد كه در دولت آل عباس پيش از او برامكه را هم نبود، تا دشمنان مجال وقيعت يافتند، و تعصب آشكارا كرده، و بى هيچ جرمى كه آن سيد بزرگوار عالم را بود امير المؤمنين صلاح ملك آن ديد كه او را بنشاند، حق سبحانه و تعالى او را فرج و خلاص بخير و عافيت وامن و رفاهيت كرامت كناد بمحمد النبي وآله.
ناقد بصير سيد علي خان مدنى طيب الله مضجعه در الدرجات الرفيعة گفته:
السيد الاجل أبو القاسم يحيى بن ابى الفضل (ابى المفضل ن خ) محمد بن على بن محمد بن النقيب المطهر المذكور قبله ملقب عز الدين المرتضى علم الهدى ذا الشرفين قال الشيخ أبو الحسن على بن عبيدالله بن بابويه في وصفه هو الصدر الكبير...
(آنگاه عبارات او را تا مقتدى العترة والال نقل كرده و گفته) كان رحمه الله خاتمة اهل بيته في الرياسة بالعراق، وعظيمهم الذى لا يزاحمه عظيم من دون اغراق، عظم في الرياسة قدره، واشرق