(1) وجود السفر مع الأسفار النبوية وليس مع الأسفار التاريخية.
(2) ذكر معجزات تختلف عن المعجزات المذكورة في الأسفار التاريخية ولا سيما النبأ المتعلق بالحوت.
(3) عدم الاتفاق بين ما قيل في توبة أهل نينوى من كبيرهم إلى صغيرهم، وما يعرف عن تاريخ نينوى وما جاء في سفر ناحوم " ويل لمدينة الدماء كلها ملآنة كذبا وخطفا " (نا 3: 1). " جرحك عديم الشفاء. كل الذين يسمعون خبرك يصفقون بأيديهم عليك ". (3: 19). وناحوم عاش بعد يونان.
(4) ما جاء في إرميا (51: 34 و 44):
" أكلني أفناني نبوخذنصر ملك بابل. جعلني إناء فارغا. ابتلعني كتنين.. وأخرج من فمه ما ابتلعه. " وهذا القول تشبيه بغير شك. فيقولون إن رواية يونان هي أيضا تشبيه ليس إلا.
أما الرأي الآخر، وهو رأي المحافظين من الشراح فيعتبره سفرا تاريخيا كتبه يونان بن أمتاي نفسه. ومما يثبت ذلك:
(1) نفس الكلام، فإنه لا يقول: " صار قول الرب إلى إنسان " بل إلى " يوناثان بن أمتاي " الخ.
(2) كلام يسوع إذا قال: " لأنه كما كان يونان في بطن الحوت الخ.. رجال نينوى سيقومون في الدين مع هذا الجيل ويدينونه، لأنهم تابوا بمناداة يونان. وهوذا أعظم من يونان ههنا. " (3) إن نبأ الحوت ليس من الحكايات التي غايتها أن تثير فضول الناس ودهشتهم، بل غايته الرمز إلى موت المسيح وقيامته. أما بخصوص توبة أهل نينوى فمن المحتمل أنهم تابوا توبة وقتية فقط. ولم تذكر هذه التوبة إلا في هذا السفر. ولعل هذا السفر جعل في عداد الأسفار النبوية لأن ما ورد فيه يرمز إلى أمور مستقبلة، كقيامة المسيح، وتبشير الأمم. وسواء قبل هذا الرأي أو ذاك فالدرس الذي يلقيه السفر واحد.
أما القصة التي يتضمنها السفر فهي:
(1) أمر الله ليونان بالذهاب إلى نينوى عاصمة الامبراطورية الأشورية ليعلن خرابها. ومحاولة يونان التملص من هذا الواجب. وإبحاره على سفينة ذاهبة إلى ترشيش في إسبانيا. وحدوث نو عظيم عزا النوتية سببه إلى عصيان يونان. فألقي في البحر، وابتلعه حوت عظيم. وبعد ثلاثة أيام قذفه الحوت إلى البر (ص 1).
(2) صلاة شكر وحمد فاه بها يونان بعد خلاصه نقل معظم ألفاظها من المزامير (ص 2).
(3) إطاعة يونان لأمر الله وكرازته في نينوى وإصغاء السكان له، وتوبتهم، وصفح الله عنهم (ص 3).
(4) اغتمام يونان بسبب ذلك، وجلوسه خارج المدينة، وتوبيخ الله له عن طريق اليقطينة التي نمت