داشت وبرخلاف پدرش ميرسيد شريف پيرو مذهب شيعي بود، ميرزا محمد على شريفى، ملقب به (ميرزا مخدوم) كه نوه ميرسيد شريف وپسر همين شمس الدين است سنى ناصبى بوده و كتاب (نواقص الروافض) را در رد شيعه ساخت، وقاضي نور الله شوشتري كتاب (مصائب النواصب)، وابو علي حائرى نيز كتاب (عذاب النواصب) را در رد همين (نواقض الروافض) نگاشتند. گويند: ميرزا مخدوم همان كسى است كه به اتفاق جمعى از گروه قلندريه بر پيرامون شاه اسماعيل صفوي ثانى (م 985 ه‍. ق) گرد آمدند، وبا انواع ترفند ونيرنگ، أو را از مذهب اثنى عشرى روى گردان ساختند، وسكه هائى را كه اسامى حضرات ائمه (عليهم السلام) بر آنها منقوش بود دگرگون ساختند.
چنين آورده اند كه شمس الدين محمد از پدرش سيد شريف - به هنگام مرگ أو - درخواست وصيتى كرد. پدر به أو گفت: (بابا به حال خود باش)، وشمس الدين محمد، مضمون اين سخن پدر را ضمن اشعاري به نظم درآورد:
مرا سيد شريف آن بحر زخار * كه رحمت بر روان پاك أو باد وصيت كرد وگفت ار زانكه خواهى * كه باشد در قيامت جان تو شاد چنان مستغرق احوال خود باش * كه از حال كسى نايد ترا ياد از آثار شمس الدين محمد جرجاني كتابهاى زير را ياد كرده اند:
(شرح هداية الحكمة للابهرى)، (شرح إرشاد الهادى للتفتازانى) در نحو، (شرح الفوائد الغياثية)، (حاشية الطوالع)، (الغرة)، (الدرة) در منطق، (زبدة الاسرار) در حكمت # ت: سده ء 9 ه‍. ق.
اين كتاب در تجويد نگارش شده وراجع به ادغام صغير وكبير بحث مى كند، ومحتواى آن در يك مقدمه ودو باب تنظيم شده است: مقدمه - در تعريف وشرائط ادغام. باب اول - در تعداد ادغام كبير مربوط به هر سوره به ترتيب آنهادر قرآن موجود. باب دوم - در ادغام صغير وانواع آن.
آغاز: بسمله، الحمد لله الذي تفضل علينا بجزيل النعم، وجعل أهل القرآن أهله وخاصته بالجود والكرم..
انجام:.. والاخفاء حالة بين الاظهار والادغام، ولابد من الغنة معه.
بنگريد به: فهرست مرعشى 2 / 307. و: ريحانة الادب 6 / 215 و 217 و 246. و: روضات الجنات، ط سنگى 186 و 498. و: هدية العارفين 2 / 189. و: دائرة المعارف الاسلامية، مقاله ء بروكلمان 6 / 334. و: الاعلام، زركلي 7 / 180. و: اعلام الشيعة، حسين على محفوظ. و: معجم المؤلفين 11 / 55.