منهج التحقيق اعتمدت في تحقيق الكتاب على أربع نسخ خطية محفوظة في خزانة مكتبة آية الله العظمى السيد المرعشي النجفي (قدس سره) في قم المقدسة هي:
1 نسخة (ج) وهي بخط المؤلف رحمه الله، وقد وقعت في يدي أثناء عملي في الكتاب.
2 نسخة (ب) وقد وقع الفراغ من استنساخها في الحادي والعشرين من شهر محرم الحرام سنة 1060 على يد علي بن محمد الحويزي.
3 نسخة (د) وهي مستنسخة ظاهرا من نسخة (ب)، لم يرد فيها اسم الناسخ ولا سنة الاستنساخ.
4 نسخة (أ) وهي نسخة مليئة بالأخطاء بالإضافة إلى عدم احتوائها على تمام تعاليق الشيخ حسن رحمه الله، وقد وقع الفراغ من استنساخها في السابع عشر من شهر شعبان سنة 1010 على يد محمد باقر بن علي أكبر الحسيني.
وقد اعتمدت على النسخة الأولى لكونها نسخة المؤلف الا إذا كان ما في النسخ الاخر هو الأصوب مع ذكر مواطن الاختلاف بين النسخ.
كما قد قدمت يتتبع أسماء المترجم لهم في الكتب الرجالية الشيعية منها