وفرغ منه في يوم الجمعة ثاني ربيع الثاني في 1180. أوله: [الحمد لله - إلى قوله - اما بعد فإنه لما بعد العهد عن زمان الأئمة ع وخفي امارات..] وأول فوائده في البحث عن أن الأحكام الشرعية توقيفية، وذكر امارات الفقهية وعظم خطره، وله نسخ مختلفة فيها تقدم بعض الفوائد على بعض وتأخرها، بل وفى عددها، والنسخة المطبوعة في آخر (الفصول) في 1270 بتصحيح الحاج مولى محمد حسن القمي، ينتهى إلى الفائدة السادسة والثلاثين، في شرايط الاجتهاد، وطبع معه (الفوائد الحائرية الجديدة) أيضا. ورأيت من النسخ الخطية كثيرا، منها ما هو عند الشيخ هادي كشف الغطاء، بخط السيد محمد رضا بن السيد محمد علي الحسيني النجفي، كتبه في 1193 وهي أيضا موجود في خزانة (سيدنا الشيرازي بسامراء) ورأيت نسختين منها في (المجلس: 2837 و 1393 طباطبائي) نسخه متداولة سبعة نسخ في (دانشگاه) كما في فهرسها. ورأيت منها نسخا في العراق، في خزانة الشيخ علي بن الشيخ محمد رضا آل كشف الغطاء بالنجف. وقد لخصه مع (الجديدة) في ثمانين فائدة، تلميذه الحاج المولى محمد حسن بن الحاج معصوم القزويني، وسماه (ملخص الفوائد السنية) كما يأتي. ثم شرح ملخصه هذا وسمى الشرح به (تنقيح المقاصد الأصولية في شرح ملخص الفوائد الحائرية) كما مر. وذكرنا للمؤلف (فوائد الأصولية) (الفوائد الجديدة) ويأتي (الفوائد الرجالية) (فوائد الفقهية) (رسالة في قاعدة الطهارة) (رسالة في القرض).
(رسالة في القياس).
(1537: الفوائد الحائرية الأصولية الجديدة) ويقال له الملحقات، أيضا لأستاذ الأكبر الوحيد البهبهاني، أوله: [الحمد لله رب العالمين حمدا لا يقوى على احصائه الا هو..] وأول فوائد البحث، في جزئية شئ لواجب وان الأصل في الجزء الركنية رأيت نسخة من (الفوائد) العتيقة والجديدة، بخط سيد زين العابدين بن أبي طالب الحسيني اللواساني، كتبه في 1216 ونسخة بخط السيد مهدي الموسوي الجيلاني في 1224 ونسخة عند الشيخ مهدي شرف الدين، ذكر انه كتبها لنفسه في الحائر أيام اشتغاله بها. وقد طبع مع (الفوائد العتيقة) في آخر (الفصول) في 1270.