انتقل إلى بغداد فيما بعد والمتوفى فيها سنة 329 ه‍، والشيخ ابن بابويه والد الشيخ الصدوق المتوفى سنة 329 أيضا والمدفون في الري، وهي السنة التي بدأت غيبة الإمام الحجة بن الحسن (عليه السلام)، وابن قولويه تلميذ الشيخ الكليني، وأستاذ الشيخ المفيد الذي انتقل إلى بغداد أيضا والمتوفى فيها سنة 369 ه‍، والشيخ الصدوق المتوفى في الري سنة 381 ه‍ والمدفون فيها، وكذلك الشيخ ابن الجنيد المتوفى في الري سنة 381 ه‍ والمدفون فيها، وغيرهم من مشايخ الفقه والحديث.
وفي الفترة الممتدة من انتقال الشيخ الكليني والعلماء الذين سبق ذكرهم إلى بغداد، إلى احتلالها من قبل السلاجقة والحوادث المؤسفة التي نتجت عنها، إلى هجرة الشيخ الطوسي إلى النجف الأشرف سنة 449، كانت الحركة العلمية فيها نشيطة دراسة وتأليفا وبحثا، كما سيأتي بيان ذلك في مدرسة بغداد مفصلا.
إليك نبذة عن تأسيس مدينة قم، ونبذة عن الحياة الفكرية والعلمية فيها.
كان بدء تمصير (قم) في أيام الحجاج بن يوسف