شجرة الأسانيد تم بحمد الله وتوفيقه جمع ثمانين سندا من أسانيد هذه الصحيفة المباركة، من طرق الخاصة والعامة، من قدماء العلماء والمحدثين ومتأخريهم، وقد ارتأت إدارة مدرسة الإمام المهدي عليه السلام أن تتصل الأسانيد بعضها ببعض، وتتشابك الطرق وتتحد، لتصل إلى الإمام علي بن موسى الرضا عليه السلام. بطريقة تشابه شجرات النسب فكرة ومضمونا.
فتحددت بذلك خمسة عشر طبقة، من الشهيد الأول محمد بن مكي العاملي، إلى الإمام الرضا عليه السلام، وبعدها أربعة عشر طبقة مفصلة في صفحة واحدة تتضمن بقية سند علماء الزيدية، حيث ينتهي إلى الشريف عبد الواسع بن يحيى الواسعي، وعنه روى الصحيفة آية الله العظمى السيد محسن الأمين - طاب ثراه - صاحب الموسوعة القيمة " أعيان الشيعة "، وعنه أيضا آية الله العظمى السيد النسابة أبو المعالي شهاب الدين النجفي المرعشي دام ظله الوارف.
ونظرا لمشاكل الطباعة، وضيق مساحة صفحة الكتاب فقد اضطررنا إلى استعمال طريقة الرموز في تنظيم هذه الشجرة، وتقسيم أسانيدها وطرقها إلى طبقات، فوضعنا كل طبقة في صفحة مستقلة، تبدأ بعدد رواة هذه الطبقة، وعدد من رووا عنه من الطبقات المتقدمة، وعدد من روى عنهم من الطبقات المتأخرة، يقابلها صفحة تتضمن قائمة أسماء، مشايخ ورواة هذه الطبقة. والحمد لله أولا وآخرا.