الأولى: اهتمامه بتراجم الأئمة من أهل البيت (عليهم السلام)، عند التاريخ لوفياتهم.
والثانية: في فصول الخلافة، كان يقول: " أيام أبي بكر، أيام عمر، أيام عثمان " ثم جاء القسم الخاص بالإمام علي عليه السلام، فقال: " خلافة علي " وبعدها: " خلافة الحسن " ثم عاد ليقول: " أيام معاوية "، فجعله بعضهم دليلا على الغلو في التشيع، وليس هو كذلك، لأن اليعقوبي كان موضوعيا، ودقيقا في كل ما نقله، حتى إن هؤلاء الخصوم لم يجدوا في أخباره ما يستدلون به على دعواهم هذه.
ترك اليعقوبي ثمانية مصنفات، وتوفي على الأرجح في أواخر سنة 292 ه‍، وقد كان حيا في شوال من هذه السنة نفسها، إذ كتب بخطه ملحقا لكتابه مختصر البلدان مؤرخا لزوال الدولة الطولونية، جاء فيه: " لما كانت ليلة عيد الفطر من سنة 292 ه‍ تذكرت ما كان فيه آل طولون في مثل هذه الليلة ".
له في التاريخ:
1 - كتاب التاريخ، المعروف ب‍: تاريخ اليعقوبي: وهو أحد أهم كتب التاريخ المعتبرة، جمع فيه بين الدقة والاختصار، فأخرجه في مجلدين:
اختص الأول: بتاريخ الأنبياء والأمم السابقة، فامتاز عن غيره من الكتب التي أرخت لهذه المراحل بقلة الأساطير، بل التصريح بتعمد تركها وعدم العناية بها، لا سيما الأساطير التي نسجت حول ملوك فارس والهند والرومان، فاكتفى بوصف ما نسجته التواريخ منها بأنه: " مما تدفعه العقول،