فهرس بعض المكتبات التي ينقل عنها المؤلف قد اقتصر والدي المؤلف دام علاه في هذا الجزء من الذريعة عند ذكره محل النسخ المخطوطة، بالإشارة إلى المكتبة رمزا، وذلك تنحيا عن التكرار والتطويل فرأيت من الواجب ان أجعل في آخر هذا الجزء فهرسا مختصرا يبين هذه الرموز.
" المصحح. ع. منزوى " مكتبة (بيت الطريحي) هي كتب متفرقة من بقية مكتبة يقال انها كانت للشيخ فخر الدين الطريحي صاحب " مجمع البحرين " المتوفى (1085) تفرقت في ورثته، وقد جمع بعضها عند الشيخ نعمة الطريحي بالنجف ثم توزعت من بعده في ورثته فأتلفت أكثرها وتوجد بعضها في بيوتهم حتى اليوم.
مكتبة (التسترية) هي مكتبة موقوفة عامة في النجف. أسسها الحاج على محمد النجف آبادي الأصفهاني المتوفى (1332) ووقف داره لمحل المكتبة ومصارفها، وأوصى بها إلى نظر على ابن محمد رضا الشوشتري الذي بنا الحسينية الشوشترية في (1319) في محلة العمارة من النجف فنقل الوصي الكتب إلى غرفة خصت للمكتبة في الحسينية، ثم زيد على المكتبة بعد ذلك كتب السيد محمد رضا الاسترآبادي الحلي المتوفى (1346) وكتب الشيخ جواد الزنجاني المتوفى بالكاظمية في (حدود 1350) وكتب الشيخ محمد تقي الهروي المتوفى بالكاظمية في (1299) وكتب المولى حسين القومشهي المتوفى بالنجف في (1336) وكتب السيد محمد المعروف ب‍ " (پيغمبر) الخامنه ئى المتوفى بالنجف (1352) وكتب الشيخ غلام حسين بن محمد حسين النجف آبادي المتوفى (1345) وكان هو أول مدير لهذه المكتبة وأخيرا أهدى إليها السيد محمد رضا التستري المعاصر (400 مجلد) من كتبه. وتشتمل المكتبة اليوم على حدود (4000 مجلد) خمسها مخطوطات.
مكتبة (التقوى) مكتبة شخصية للحاج السيد نصر الله التقوى من بيت سادات أخوى الشهيرة ورئيس ديوان التمييز سابقا في طهران وهي مكتبة نفيسة جلها مخطوطات.
مكتبة (حسينية كاشف الغطاء) مكتبة عظيمة أسسها أولا الشيخ على بن محمد رضا آل كاشف الغطاء المتوفى (1350) في النجف، ثم زاد عليها ورتبها ولده الشيخ الحجة محمد الحسين المعاصر، ونقلها إلى محل خاص لاستفادة العموم منها، بناها لها في المدرسة المعروفة بمدرسة المعتمد في محلة العمارة بالنجف، وكان قد بنا المدرسة الشيخ مهدي ابن الشيخ على كاشف الغطاء من أموال معتمد الدولة عباس قلى خان المتوفى (1269) وزير محمد شاه القاجاري.
مكتبة (الحسينية بالكاظمية) أسس سيدنا السيد محمد الحيدري في (1297) المدرسة المعروفة بالحسينية الحيدرية في الكاظمية وجعل لها مكتبة صغيرة كانت متروكة إلى سنة (1353) حيث قام لفيف من رجال البيت الحيدري باحياء المكتبة ثانيا فأهدوا إليها كتبا وجعلوا لها فهرسا وبرنامجا وبنوا لها محلا خاصا في الحسينية، وسموها مكتبة الإمام الصادق وفيها اليوم زهاء (1500 مجلد).