ونشأ محمد بن عثمان وترعرع في بيئة علمية، فأبوه عثمان، روي عنه البخاري ومسلم وأبو داود وغيرهم... وكذا عمه عبد الله بن محمد، فبيته بيت علم وحديث... كما أن الكوفة في عصره كان يشد إليها الرحال لكثرة علمائها في مختلف الفنون... أضف إلى ذلك استعداده الفطري، وحافظته القوية، ورغبته في العلم ومعاصرته لحفاظ زمانه جعلته يتصدر المكانة المرموقة بين علماء عصره حتى قيل: مات حديث الكوفة بموت فلان وفلان وهو واحد منهم... وبعد أن كبر واشتد عوده إنتقل إلى بغداد وسكنها، والذي يظهر لنا أنه أحب بغداد وأهلها لما رأي من أهلها من حب العلم وأهله كما أن أهل بغداد عرفوا قيمته ومنزلته قال جعفر بن محمد بن نمير الخلدي: سمعت محمد بن عثمان ابن أبي شيبة، وقد قال له قوم غرباء من أصحاب هذا الحديث: يا أبا جعفر نحن قوم غرباء فزدنا، فقال: لكم حق ولجيراني حقوق، هؤلاء يعني من حوله من أهل بغداد، إن مرضت عادوني وإن مت حضروني، وإن مروا بقبري ترحموا علي وأنتم تفارقوني، ولا أعلم ما يكون منكم وبقي في بغداد حتى فارق الحياة رحمه الله تعالى سنة سبع وتسعين ومائتين.
طائفة من شيوخه:
1 - والده وهو (الحافظ أبو الحسن عثمان بن محمد بن إبراهيم بن عثمان العبسي، مولاهم الكوفي المعروف بابن أبي شيبة، روى عن شريك وهشيم وابن المبارك وخلق، روى عنه عبد الله بن أحمد والبخاري، ومسلم، وأبو داود والنسائي وابن ماجة والبغوي وابنه محمد وغيرهم وصنف المسند، والتفسير قال ابن حجر: ثقة حافظ شهير، وله أوهام وقيل: كان لا يحفظ القرآن توفي سنة تسع وثلاثين ومائتين...).