وهزم منكان معه ورجع الزبير فقتل بوادي السباع قتله عمرو بن جرموز وأحيط بعائشة فأخذت ودخل علي البصرة بمن معه فبايعه أهل البصرة وأطلق عثمان بن حنيف ولم يكن له بها كثير مقام حتى ا نصرف إلى الكوفة واستعمل على البصرة عبد الله بن عباس وتهيأ لحرب معاوية فسار بأهل العراق ومن تبعه من سائر الناس وأقبل معاوية في أهل الشام ومن اتبعه فكانت وقعة صفين ثم الحكمان ولم يزل في حرب حتى قتل عليه السلام ولم يحج في شئ من سنيه لشغله بالحرب وقتل ليلة الجمعة لتسع عشرة ليلة مضت من شهر رمضان سنة أربعين وكانت ولايته خمس سنين إلا ثلاثة أشهر وقتله عبد الرحمن بن ملجم المرادي وقال الواقدي دفن ليلا وعمى قبره قال أبو اليقظان صلى عليه الحسن ودفن بالكوفة عند مسجد الجماعة في قصر الإمارة حلية علي وسنه رضي الله عنه واختلفوا في سنة فقال ابن إسحاق قتل وهو أبن ثلاث وستين سنة وقال غيره قتل وهو ابن ثمان وخمسين سنة واختلفوا في حليته