تعداد اين قرآنها فزونى يافته وكتابهاى ديگرى از قبيل كتب حديث وتفسير هم بر آنها افزوده شده است. در اواخر سده ء دهم هجري، كتابخانه ء داراى كتابهاى بسيار وگرانبهايى بوده است. اين كتابخانه ء اولين كتابخانه أي است كه در ايران به نشر فهرست اقدام كرده است. نخستين فهرست، در زمان نيابت توليت ميرزا سعيد خان انصاري، تدوين وذيل جلد دوم مطلع الشمس چاپ شد.
دومين مجلد اين فهرست به دستور محمد وليخان اسدي - نيابت توليت وقت - در 1305 ه‍.
ش، منتشر شد. مجلد اول، در چاپ دوم، توسط سيد على اردلان جوان: تحقيق وباز نگارى شده است.
تاكنون يازده جلد از اين فهرست منتشر شده است.
مجلد اول (چاپ اول) تأليف افسر، شيخ محمد خالصي، مرتضى قليخان نائينى، حاج عماد المحققين واعظ تهرانى معروف به (عماد فهرستى)، ميرزا على اكبرى شهيدى ثقة الاسلام، واوكتائى، چاپخانه ء نو بهار، تير 1305 ه‍. ش، 96 + 24 + 52 + 76 + 12 + 108 + 32 + 22 ص.، رحلى.
در آغاز، پيشگفتارى از اوكتائى - رئيس وقت كتابخانه ء آستانه ء مقدسه - در مورد آستانه ء مقدسه وكتابخانه ء آن، ومقدمه أي درباره ء علم الهى و.. است.
اين مجلد، شامل كتب خطى وچاپى، به اين ترتيب: * كتب خطى حكمت وكلام وتصوف (12 - 95) * كتب چاپى حكمت وكلام وتصوف (1 - 23) * كتب خطى منطق (1 - 50) * كتب خطى تفسير (1 - 47) * كتب چاپى تفسير (1 - 9) * كتب خطى اخبار (1 - 105) * كتب چاپى اخبار (1 - 32).
ترتيب معرفى: شماره ء راهنما، كتابشناسى، ونسخه شناسى.
تنظيم معرفى نامه ها: الفبايى.
اضافات:
1. غلطنامه (1 - 21).
مجلد اول (چاپ دوم، ويرايش دوم) تحقيق وبازنگارى سيد على اردلان جوان، انتشارات كتابخانه ء مركزي آستان قدس رضوى (ع)، شماره ء 12، بهمن 1365 ه‍. ق، 748 ص.، وزيرى.
در آغاز، بعد از تقديم كتاب به مناسبت نهمين سالگرد انقلاب اسلامي ايران، مقدمه أي از ر. ع. شاكري - سرپرست كتابخانه ء مركزي آستان قدس - در مورد تجديد چاپ اين مجلد، وپيشگفتارى از مؤلف درباره ء ويرايش دوم كتاب، وتوضيحات راجع به علائم اختصاري اين فهرست است.
اين مجلد شامل نسخ خطى به اين ترتيب است: * حكمت وكلام وعرفان (25 - 254) * منطق (257 - 397) * تفسير (401 - 599).
ترتيب معرفى: شماره ء راهنما، كتابشناسى، ونسخه شناسى.